Polikistik over sendromu'nda yumurtayı taşıyan küçük kesecik büyümemekte ve yumurtlama olmamaktadır. Bunun sonucunda sperm ile karşılaşacak yumurta olmadığı için gebelik oluşmaz. Yumurtanın büyüyüp, yumurtlamanın olmaması (Anovulasyon) gebe kalmakta zorluk yaşayan 5 kadından birinde görülmektedir. Bunlarında büyük çoğunluğunu polikistik over sendromu oluşturmaktadır.
Polikistik over sendromu olan gebe bir kadında ilk karşılaştığımız risk düşük yapmaktır. (abortus). Bu kadınların yarıya yakını ilk 10-12 haftaya kadar düşük yapmaktadır. İnsülin direnci, glukoz intoleransı ve şeker hastalığı ile düşük yapma arasında bir ilişki olduğu anlaşılmıştır. Gebelik öncesi dönemde insülin direncinin, glukoz intoleransı ve şeker hastalığının kontrol altına alınması ve tedavinin düzenlenmesi gerekir.
Fazla kilo ve şişmanlıkta düşük yapma riskini arttıran diğer bir nedendir. Polikistik over sendromu olan kadınların yarısından çoğu fazla kilolu yada şişmandır. Bu nedenle gebelik öncesi dönemde fazla kiloların verilmesi düşük yapma riskini azaltır.
Polikistik over sendromu olan bir gebede karşılaştığımız diğer bir riskte gebelikte ortaya çıkan şeker hastalığı (gestasyonel diabetes mellitus).Polikistik over sendromu olan kadınların büyük çoğunluğunda gebelik öncesi dönemde insülin direnci ve glukoz intoleransı zaten görülmektedir. Bu nedenle bu kadınlar gebelikte ortaya çıkabilecek şeker hastalığı için riskli grubu oluşturmaktadır.Gebelik altta yatan şeker hastalığını ortaya çıkarabilen bir durumdur.
Polikistik over sendromu olan gebelerde preeklampsi (gebelikte ortaya çıkan yüksek tansiyon ile birlikte idrarda protein kaybı ve vücutta şişlik) ve erken doğum riski de artmaktadır. Yukarıda belirtilen riskler göz önüne alındığında polikistik over sendromu olan bir kadının gebeliği yüksek riskli gruba girmektedir.